Az MLSZ fegyelmi bizottsága kizárta a 2008-2009-es NB II-es bajnokságból a Dunaújvárost, mivel a klub képviselője hivatalosan bejelentette a visszalépést.
A határozat 15 nap múlva emelkedik jogerőre, ezután a dunaújvárosiak valamennyi őszi eredménye érvényben marad, a következő fordulókban a csapat aktuális ellenfele szabadnapos lesz, s automatikusan megkapja a mérkőzés 3 pontját, 3-0-ás gólkülönbséggel.
Az egyesület felnőtt csapata a 2009-2010. bajnoki évtől kezdődően csak két osztállyal alacsonyabb bajnokságban, azaz a megyei I. osztályban vehet részt.
A testület az FC Fortuna Szeged 2008-2009-es II. osztályú férfi U19-es és U17-es bajnokságban résztvevő csapatait a bajnokságból 2009. június 30-ig kizárta, mert a szervezet képviselője bejelentette a visszalépést. A klub ezen korosztályú csapatai a 2009-2010. bajnoki évtől kezdődően csak két osztállyal alacsonyabb bajnokságban vehetnek részt.